視頻顯微鏡在工農業和科研各部門有著廣泛的應用。根據實際使用情況常見的故障有：視場較模糊或有臟物，可能的原因有標本上有臟物，目鏡表面有臟物，物鏡表面有臟物，工作板表面有臟物?？筛鶕嶋H情況采取清潔標本，目鏡，物鏡和工作板表面的臟物解決。
 

　　雙像不重合可能的原因為瞳距調節不正確可采取修正瞳距的措施，雙像不重合也可能是視度調節不正確可采取重新進行視度調節，還有可能是左右目鏡倍率不同可檢查目鏡并重新安裝相同倍率的目鏡。
 

　　如果是圖像不清晰可能是物鏡表面有臟物請清潔物鏡。如果變焦時圖像不清晰有可能是視度調整不正確和調焦不正確，可重新進行視度調節和調焦。若發生燈泡經常燒掉和燈光閃爍不定的情況時，則也許是當地的線電壓太高，燈泡快燒壞了和電線連接不良，請仔細檢查電壓和顯微鏡的電線連接情況是否牢固，如不是則可能是燈泡快燒壞了可重新更換燈泡解決。
 

　　視頻顯微鏡的放大倍率具有超高的連續可調的功能，其變焦能力也具有可連續調節，測量時可通過視頻顯微鏡上搭配的圖像采集軟件，收集顯示屏或計算機上觀察到的一定放大倍數的圖像，再利用搭配的圖像分析軟件直接對放大圖像直接進行三維定量測量，并在圖像上直接疊加測量標記。視頻顯微鏡主要是透過顯示屏來觀察的，與常規的光學顯微鏡用雙目觀察不同，視頻顯微鏡的實際放大倍數的計算方法也不同。